För några månader sedan publicerade vi en Optimist's Edge artikel om hur vetenskapen försöker hitta ett botemedel mot åldrande. Proteiner spelar en stor roll i åldrandet och faktum är att de spelar en stor roll i nästan alla biologiska processer. Proteiner har en mängd olika uppgifter i kroppen och deras egenskap och funktion bestäms av dess form.

Formen avgörs av den sekvens av aminosyror som proteinet är uppbyggt av. Att det är på det viset var från början en teori som nobelpristagaren Christian Anfinsen delade med sig av under sitt nobeltal år 1972. Sedan dess har en mängd försök gjorts av att bara med hjälp sekvensen av aminosyror skapa en 3D-bild av protein. Men alla försök att med datorns hjälp räkna ut formen har, fram till förra året, varit ganska oexakta.

Det Google-ägda företaget DeepMind utvecklad 2020 en AI kallad AlphaFold, som kan förutsäga en viss proteins form så säkert som upp till en bråkdel av en atoms bredd.
De har nu publicerat en databas med 350 000 former av proteiner från 20 olika viktiga livsformer. Databasen innehåller även formen på de cirka 20 000 olika proteinerna i människans genom. De har även släppt källkoden för AI:n.

Men DeepMind utlovar också att släppa 100 miljoner fler former- motsvarade alla proteiner som överhuvudtaget är kända av vetenskapen, de närmaste månaderna.

Enligt uppskattningar har forskare sedan tidigare enbart kunnat identifiera formen på 17 procent av människokroppens proteiner. Med DeepMinds verktyg har alltså vetenskapen tagit inte bara ett kliv utan ett "stormsteg". För att kunna bota sjukdomar behöver man förstå processerna bakom och för att skapa läkemedel behöver man veta hur läkemedlet påverkar proteinerna i kroppen.

I ett pressmeddelande på DeepMinds hemsida skriver de:

" Som ett kraftfullt verktyg som stödjer forskare, tror vi att detta är det viktigaste bidraget som AI hittintills har lett till vad gäller att föra vetenskapen frammåt. Det är också ett bra exempel på hur AI kan leda till fördelar för mänskligheten. "

Databasen har redan använts av forskarlag runt om i världen och DeepMind slår fast att de är angelägna om att proteinformerna ska bli allmänt tillgängliga för alla att ta del av. Exempelvis har forskare i San Fransisco använt insikterna kring proteinformerna för att lära sig mer om SARS-CoV-2.

Läs hela vetenskapliga artikeln här.

🧬 Människans hela genom är nu (nästan) helt kartlagt (warpnews.se)